В статье рассматривается алгоритмическое обеспечение информационной системы поддержки принятия решения по управлению рисками программных проектов (ИСППР). Выделены задачи, решение которых должна обеспечить система: выделение и описание множества рисков и рискообразующих факторов, оказывающих критическое влияние на результаты программного проекта; качественное и количественное описание рискообразующих факторов; комплексная оценка проявления итогового риска проекта и выбор одной из возможных стратегий управления. Определены четыре категории рисков, возникающих при реализации программных проектов, предложена схема содержательного описания рисков и рискообразующих факторов и шкала их оценивания. Для комплексной оценки проявления итогового риска проекта и выбора одной из возможных стратегий управления использован алгоритм нечеткого вывода Мамдани. Для реализации алгоритма сформирована база правил нечеткой системы, определены функции принадлежности входных переменных. Приведены результаты расчетов по оценке рисков программы продвижения webориентированной геоинформационной технологии формирования и мониторинга электронного генерального плана предприятия. В статье дается интерпретация полученных результатов и предлагается сценарий по реагированию на них. Полученные результаты в практическом плане могут быть полезны менеджерам программных проектов малых IT-компаний.