Рассмотрены индекс производства продукции сельского хозяйства Республики Адыгея, доля инвестиций в основной капитал в валовом региональном продукте (ВРП), реализация инвестиционных проектов, структура инвестиций по отраслям экономики, а также инновационная инфраструктура региона. Выявлены основные проблемы, связанные с финансированием предприятий и обозначены действующие позитивные и негативные факторы развития экономики республики. Предложена организационная структура региональной инновационной системы в АПК региона.