Взаимосвязь гидрофобности молекул аминокислот и дипептидов с их физико-химическими параметрами
Предпринята попытка вычисления LogP молекул 20 аминокислот и 13 дипептидов на основе выявления его корреляции с различными их физико-химическими параметрами.
Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
Е.Ю. Тюнина, В.Г. Баделин
ВЗАИМОСВЯЗЬ ГИДРОФОБНОСТИ МОЛЕКУЛ АМИНОКИСЛОТ И ДИПЕПТИДОВ
С ИХ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИМИ ПАРАМЕТРАМИ
(Институт химии растворов РАН)
E-mail: vis@isc-ras.ru, tey@ isc-ras.ru
Представлены результаты определения логарифмического коэффициента распределения
(logP) для 20 аминокислот и 13 дипептидов на основе выявления его корреляции
с различными физико-химическими параметрами, в той или иной степени ответственными
за вклады в совокупную гидрофобность соединения. <...> Предложены три уравнения
регрессии для оценки неизвестных значений logP пептидов. <...> Несмотря на существование различных
шкал гидрофобности [1,7-9], широкое
распространение в качестве характеристики гидрофобности
вещества получил логарифм коэффициента
распределения (logP) вещества между
двумя несмешивающимися фазами (например,
вода-октанол) [1-5,10,11]. <...> В данной работе предпринята попытка вычисления
logP молекул 20 аминокислот и 13 дипептидов
на основе выявления его корреляции с
различными их физико-химическими параметрами. <...> Широко применяемые
корреляционные подходы могут быть
подразделены на формальные и физические. <...> Особенность
формальных моделей – использование
универсального математического аппарата, не
связанного особо с какими-либо конкретными фиХИМИЯ
И ХИМИЧЕСКАЯ ТЕХНОЛОГИЯ 2009 том 52 вып. <...> 4
зическими представлениями, например, квантовохимическая
модель CoMFA (comparative molecular
field analysis) [14]. <...> В представленной работе применена
не просто формальная модель, но с учетом
физического содержания параметров, исходя из
структуры исследуемых аминокислот и пептидов. <...> Кроме того, в задачу работы входило найти уравнение,
которое является функцией небольшого
числа структурно-базовых дескрипторов и вполне
корректно описывает экспериментальные значения
параметра гидрофобности молекул. <...> К числу
структурных дескрипторов, в той или иной степени
ответственных за вклады в совокупную гидрофобность
соединений, следует отнести общую
молекулярную поверхность (Sa <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности
Похожие документы: