В работе представлены результаты изучения ковыля украинского (Stipa ucrainica) и ковыля Залесского (Stipa zalesskii) с территории Ростовской обл. с помощью анализа морфологических признаков и ISSR-анализа. Данные, как одномерного и многомерного морфологических анализов, так и распределения ISSR-фрагментов, полученные при изучении растений из трех популяций Stipa ucrainica и четырех популяций Stipa zalesskii, свидетельствуют о высокой степени различия между видами, что позволяет принять одну из двух существующих точек зрения и говорить о независимости Stipa ucrainica и Stipa zalesskii.