В статье освещена система правового регулирования лицензирования медицинской и фармацевтической деятельности по праву Всемирной торговой организации, Таможенного союза и российскому законодательству. Выявлены тенденции регулирования лицензирования правом Евразийского экономического союза: либерализация, унификация и гармонизация. Применительно к российскому правовому регулированию обращено внимание на содержание подзаконных нормативных правовых актов, определяющих особенности лицензирования в сфере медицинской и фармацевтической деятельности. Теоретические положения проиллюстрированы примерами из судебной практики. Указаны основные теоретические (доктринальные) аспекты понимания лицензирования.