Предмет. Статья посвящена формализации алгоритма взаимодействия агентов в региональной системе на примере моделирования занятости населения по видам экономической деятельности в Республике Башкортостан. Цели. Разработать алгоритм распределения агентов, представляющих занятое население муниципального образования в многоагентной региональной системе, по видам экономической деятельности. Методология. Использован алгоритм Гейла – Шепли. Результаты. Разработан алгоритм распределения агентов, представляющих занятое население муниципального образования в многоагентной региональной системе, по видам экономической деятельности. Выводы. Сделан вывод о том, что распределение агентов, представляющих занятое население в многоагентной региональной системе, по видам экономической деятельности позволяет достоверно воссоздать структуру занятости в регионе.