РУсскоязычный Архив Электронных СТатей периодических изданий
Молекулярная генетика, микробиология и вирусология/2016/№ 1/

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ MLVA25- И MLVA7-ТИПИРОВАНИЯ ПО СПОСОБНОСТИ ОПРЕДЕЛЯТЬ ОЧАГОВУЮ ПРИНАДЛЕЖНОСТЬ ШТАММОВ Yersinia pestis НА ПРИМЕРЕ ИЗОЛЯТОВ ИЗ ЦЕНТРАЛЬНО-КАВКАЗСКОГО ВЫСОКОГОРНОГО ОЧАГА ЧУМЫ

Проведен сравнительный анализ MLVA25- и MLVA7-типирования по способности определять очаговую принадлежность штаммов Y. pestis на примере изолятов bv. medievalis из ЦентральноКавказского высокогорного очага чумы. Для этого определили MLVA25-генотипы 82 изолятов с указанной территории и ввели эти данные в базу, включавшую информацию о 949 штаммах чумного микроба из других природных очагов России, ближнего и дальнего зарубежья. Для построения дендрограмм применяли метод UPGMA с категорическим коэффициентом, используя данные обо всех 25 имеющихся в ней локусах VNTR или только о семи из них, рекомендованных специалистами Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» для дифференциации штаммов Y. pestis по очаговой принадлежности. Полученные результаты свидетельствуют о большей вероятности диагностических ошибок при использовании для определения внутривидовой принадлежности метода MLVA7-типирования и указывают на целесообразность подразделения ЦентральноКавказского высокогорного очага чумы на два мезоочага.

Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности

Похожие документы: