В данной работе приведены результаты анализа присутствия в геномах штаммов Vibrio cholerae non-O1/non-O139, выделенных из судовых балластных вод и прибрежной зоны Таганрогского залива, нуклеотидных последовательностей интегронов класса 1 (In1) и интегративных конъюгативных элементов семейства SXT/R391. Интактный фрагмент 3’-консервативного сегмента In1 (qacEdelta1-sul) детектирован в 3 штаммах (33, 59, 182), тогда как в штаммах V. cholerae 28 и 52 выявлены вероятные изменения последовательности-мишени (дупликация и делеция соответственно). Фрагмент гена интегразы intSXT SXT/R391 обнаружен в 7 из 10 исследованных штаммов.