Рассмотрены состояние и тенденции функционирования финансово-экономических отношений в интегрированных формированиях АПК на основе внедрения управленческого учета и системы бюджетирования. По результатам анкетного опроса выявлены особенности и определены перспективы их развития в агрохолдингах.