ПОДХОД К ПОДБОРУ ДНК-МИШЕНИ К ТЕСТ-СИСТЕМЕ ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПРОВИРУСА ЛЕЙКОЗА КРС

Вирус лейкоза КРС ПЦР ПЦР-рт.

ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ ПРЕПАРАТА «ВЕКТРА 3Д» ПРИ ДЕМОДЕКОЗЕ И ХЕЙЛЕТИЕЛЛЕЗЕ СОБАК., СЕРОЛОГИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА МЕТОДОМ ИММУНОБЛОТТИНГА ПРИ ХРОНИЧЕСКОЙ И БЕССИМПТОМНОЙ ФОРМАХ АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ, ...

УДК 619:616 =07.006 ПОДХОД К ПОДБОРУ ДНК-МИШЕНИ К ТЕСТ-СИСТЕМЕ ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПРОВИРУСА ЛЕЙКОЗА КРС Маркарян А.Ю. <...> Рассмотрен принцип взаимодействия вирусов и клеток, исходя из которого определена стратегия подхода к подбору молекулярно-генетической тест-системы вируса лейкоза КРС. <...> Рассмотрены подходы определения области ДНК-мишени, алгоритм подбора и дизайна праймеров. <...> Проведен анализ более 50-ти наиболее дискордантных последовательностей нуклеиновых остатков области LTR BLV в плане выявления мотивов (наиболее консервативных последовательностей). <...> Последующая обработка представлена с использованием алгоритма программы вектор NTI и выравниваем последовательностей с использованием алгоритма BLAST NCBI. <...> Длина ДНК-мишени проектировалась в диапазоне 150-200 пар нуклеотидов. <...> Разработанная тест-система работает, как в простом диапазоне ПЦР с анализом электрофоретической подвижности амплифицированного фрагмента провируса ВЛКРС, так и подобрана система для проведения ПЦР в режиме реального времени. <...> Вызывает заболевание вирус BLV (Bovine leukemia virus), который относят к роду Deltaretrovirus. <...> При создании тест-систем для выявления инфицированных животных необходимо учитывать не только принцип воздействия вируса на клетку, но также и воздействие клетки на вирус, как два совместно действующих модуля. <...> Так, на сегодняшний день только на основе анализа полиморфизма длин рестриктных фрагментов (ПДРФ) структурного гена env ВЛКРС отражено семь генетических вариантов, и такая вариабельность представлена, более или менее во всех структурных генах вируса, что собственно нетрудно рассмотреть при первичном анализе последовательностей ДНК в базе данных GenBank NCBI. <...> При данном положении и тривиальном подходе по подбору праймеров для разработки тест систем кажется логичным множественный подбор всех вариантов праймеров, учитывающих изменчивость вириона, однако данный тезис отрицается конкурирующим антагонизмом взаимодействия вариабельных <...>

• Похожие документы из РУАЭСТ
• |
• Похожие документы из Руконт