ПОЛУЧЕНИЕ РЕКОМБИНАНТНЫХ HU-БЕЛКОВ ИЗ S. MELLIFERUM И M. GALLISEPTICUM И ИХ КОМПЛЕКСОВ С ДЦДНК ДЛЯ СТРУКТУРНЫХ ЯМР-ИССЛЕДОВАНИЙ
Cоздана высокоэффективная система бактериальной экспрессии и протокол очистки рекомбинантных HU-белков, меченных изотопами 13C и 15N, из микоплазм S. Melliferum (HUSpm) и M. gallisepticum (HUMgal), пригодных для структурных исследований с помощью ЯМР-спектроскопии высокого разрешения, а также подобраны условия проведения ЯМР-экспериментов и получены обзорные двумерные гетероядерные ЯМР-спектры 1H/15N-HSQC и 1H/13С-HSQC-CT свободных форм HU-белков (HUSpm и HUMGal), а также спектр 1H/15N-HSQC HUSpm в присутствии ДНК-дуплекса. Разработанные методики универсальны, применимы для других представителей семейства HU-белков, позволяют проводить структурно-динамические исследования белков в свободной форме и изучение их конформационных перестроек при образовании комплексов с различными видами ДНК-дуплексов или ингибиторами ДНК-связывания.
Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
GALLISEPTICUM И ИХ
КОМПЛЕКСОВ С ДЦДНК ДЛЯ СТРУКТУРНЫХ
ЯМР-ИССЛЕДОВАНИЙ
Д.А. <...> Ракитина1,2*
(1Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»; 2Институт
биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; <...> *e-mail: taniarakitina@yahoo.com)
Cоздана высокоэффективная система бактериальной экспрессии и протокол очистки
рекомбинантных HU-белков, меченных изотопами 13C и 15N, из микоплазм S. <...> Melliferum (HUSpm) и M. gallisepticum (HUMgal), пригодных для структурных исследований
с помощью ЯМР-спектроскопии высокого разрешения, а также подобраны
условия проведения ЯМР-экспериментов и получены обзорные двумерные
гетероядерные ЯМР-спектры 1H/15N-HSQC и 1H/13С-HSQC-CT свободных форм
HU-белков (HUSpm и HUMGal), а также спектр 1H/15N-HSQC HUSpm в присутствии
ДНК-дуплекса. <...> Разработанные методики универсальны, применимы для других
представителей семейства HU-белков, позволяют проводить структурно-динамические
исследования белков в свободной форме и изучение их конформационных
перестроек при образовании комплексов с различными видами ДНК-дуплексов или
ингибиторами ДНК-связывания. <...> Список использованнных в статье сокращений: NAP – белок, ассоциированный
с нуклеоидом; HU – гистоноподобный белок; HUSpm – гистоноподобный белок из
Spiroplasma melliferum; HUMgal – гистоноподобный белок из Mycoplasma gallisepticum;
РСА – рентгеноструктурный анализ, ЯМР – ядерный магнитный резонанс; TEV – вирус
гравировки табака; ИПТГ – изопропилтиогалактозид; ДСН-ПААГ – полиакриламидный
гель с додецилсульфатом натрия; МХАХ – металл-хелатная аффинная хроматография,
Ni-NTA – никель-нитрилотриацетат. <...> В связи с высокой стоимостью изотопных меток при переходе на минимальные среды проводят дополнительную оптимизацию условий экспрессии в целях подбора условий, позволяющих получить максимальное количество рекомбинантного белка с минимального объема среды. <...> 4 В настоящей работе подобраны условия бактериальной экспрессии двух рекомбинантных НUбелков, меченных изотопами, из микоплазм S. melliferum <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности
Похожие документы: