Cтатистические характеристики гидратных оболочек белков. Компьютерное моделирование
Молекулы воды и сетка водородных связей являются обязательными структурными компонентами во многих биологических макромолекулярных системах, таких как нуклеиновые кислоты, фибриллярные и глобулярные белки. Известно, что плотность воды в гидратных оболочках белка отличается от плотности объемной воды. В настоящей работе плотность рассмотрена как пространственная функция расстояния от поверхности белка. Аналогично рассмотрены значения функций электростатического потенциала. Полученные профили плотности в слое связанной воды характеризуются наличием ряда четко выраженных максимумов, объясняющихся упорядоченным строением гидратной оболочки на расстоянии, превышающем 7 A˚. Наблюдаемые небольшие различия в профилях функций распределения плотности и электростатического потенциала для разных белков обусловлены топологическими изменениями, обнаруженными нами ранее при исследовании функций распределения валентных и торсионных углов связанной воды с этими белками.
Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
Молекулы воды и сетка водородных связей являются обязательными структурными компонентами во многих биологических макромолекулярных системах, таких как нуклеиновые кислоты, фибриллярные и глобулярные белки. <...> Известно, что плотность воды в гидратных оболочках белка отличается от плотности объемной воды. <...> В настоящей работе плотность рассмотрена как пространственная функция расстояния от поверхности белка. <...> Полученные профили плотности в слое связанной воды характеризуются наличием ряда четко выраженных максимумов, объясняющихся упорядоченным строением гидратной оболочки на расстоянии, превышающем 7 A. <...> Наблюдаемые небольшие различия в профилях функций распределения плотности и электростатического потенциала для разных белков обусловлены топологическими изменениями, обнаруженными нами ранее при исследовании функций распределения валентных и торсионных углов связанной воды с этими белками. <...> Молекулы воды и сетка водородных связей являются обязательными структурными компонентами во многих биологических макромолекулярных системах, таких как нуклеиновые кислоты, фибриллярные и глобулярные белки. <...> Известно, что плотность воды в гидратных оболочках белка отличается от плотности объемной воды. <...> В настоящей работе плотность рассмотрена как пространственная функция расстояния от поверхности белка. <...> Полученные профили плотности в слое связанной воды характеризуются наличием ряда четко выраженных максимумов, объясняющихся упорядоченным строением гидратной оболочки на расстоянии, превышающем 7 A. <...> Наблюдаемые небольшие различия в профилях функций распределения плотности и электростатического потенциала для разных белков обусловлены топологическими изменениями, обнаруженными нами ранее при исследовании функций распределения валентных и торсионных углов связанной воды с этими белками. <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности
Похожие документы: