ДЕКОМПОЗИЦИЯ СТРУКТУРЫ ПАТТЕРНА СКРЫТОЙ ПРОФИЛЬНОЙ ПЕРИОДИЧНОСТИ В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК

скрытая профильная периодичность спектральностатистический подход кодирующие районы ДНК декомпозиция паттерна периодичности.

ПРИБЛИЖЕННЫЙ ЧИСЛЕННЫЙ РАСЧЕТ ДИАГРАММЫ НАПРАВЛЕННОСТИ ПОЛЯ, РАССЕЯННОГО МЕТАЛЛИЧЕСКИМ ТЕЛОМ, НА ОСНОВЕ РЕГУЛЯРИЗОВАННОГО МЕТОДА ВСПОМОГАТЕЛЬНЫХ ТОКОВ, СТРУКТУРНЫЕ РАЗЛИЧИЯ КОДИРУЮЩИХ И НЕКОДИРУЮЩИХ РАЙОНОВ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА, ...

В. А. Кутыркин , М. Б. Чалей ДЕКОМПОЗИЦИЯ СТРУКТУРЫ ПАТТЕРНА СКРЫТОЙ ПРОФИЛЬНОЙ ПЕРИОДИЧНОСТИ В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК Рассмотрены методы декомпозиции случайных паттернов периодичности кодирующих последовательностей ДНК, в которых наблюдается скрытая профильная периодичность. <...> E-mail: vkutyrkin@yandex.ru, maramaria@yandex.ru Ключевые слова: скрытая профильная периодичность, спектральностатистический подход, кодирующие районы ДНК, декомпозиция паттерна периодичности. <...> Понятие скрытой профильной периодичности (профильности) в последовательностях ДНК введено в работе [1]. <...> Для распознавания наличия профильности в ДНК был разработан специальный спектрально-статистический подход [2, 4]. <...> Согласно этому подходу, последовательность ДНК рассматривается как реализация случайной строки, составленной из независимых случайных букв, каждая из которых задается вероятностным распределением четырех букв алфавита ДНК, соответствующих четырем нуклеотидам (нукл.) <...> Такую случайную строку называют периодичной, если ее можно представить в виде последовательного повторения некоторой подстроки, называемой паттерном периодичности. <...> Если вся строка периодична, ее называют случайным тандемным повтором, определяемым таким паттерном. <...> В этом случае паттерн, состоящий из строки случайных букв, определяет мультиполиномиальную схему из N независимых испытаний, где N — длина случайного тандемного повтора и его реализаций (последовательностей ДНК). <...> При этом паттерн в виде заданной строки случайных букв определяет профиль мультиполиномиальной схемы из N независимых испытаний. <...> Таким образом, мультиполиномиальная схема получена соответствующим сцеплением полиномиальных схем, каждая из которых определяется одной из случайных букв в составе паттерна. <...> Разработанный спектрально-статистический подход [2, 4] позволяет оценить не только период скрытой профильной периодичности последовательностей ДНК, но и ее случайный паттерн. <...> Поэтому <...>

• Похожие документы из РУАЭСТ
• |
• Похожие документы из Руконт