На базе Лимнологического института СО РАН функционирует холодноводный пресноводный аквариумный комплекс, деятельность которого направлена на проведение экспериментальных работ по выяснению закономерностей функционирования экосистемы оз. Байкал. Комплекс работает на основе модульного принципа и состоит из четырех автономных независимых блоков – проточных и замкнутых установок с регулируемыми параметрами среды. В нём содержатся как космополитные, так и эндемичные виды, принадлежащие разным таксономическим группам – более 80 культур одноклеточных водорослей и цианобактерий, 27 видов гидробионтов