В основе проектирования систем информационного обеспечения для решения задач современной биотехнологии и биомедицины лежат идеи применения когнитивной биоинформатики при создании социальных семантических сетей. В статье рассмотрены некоторые проблемы, возникающие при разработке таких систем.