В статье рассматривается проблема совершенствования инвестирования инновационного развития региона как важного фактора социально-экономической трансформации. Систематизированы факторы реализуемости (риска) инновационных проектов. Разработана модель определения оптимальной структуры инвестирования инновационной программы.