В обзоре приведены результаты исследований по биодеградации полигидроксиалканоатов (ПГА) в природных пресноводных и морских экосистемах. Факторы, определяющие скорости деградации полимеров в условиях водоема, включают температуру и минеральный состав воды, структуру водной экосистемы и состав бактериопланктона. При наличии в водоеме аэробной и анаэробной зон анаэробная деградация протекает с меньшими скоростями по сравнению с аэробной. Одним из факторов, ограничивающих скорости деградации ПГА, является недостаток растворенного минерального фосфора, препятствующий развитию микробных сообществ экосистемы. Отличия в особенностях биодеградации ПГА обусловлены также различными структурой и поверхностью образцов, влияющими на адгезию микроорганизмов. Бактерии являются основными деструкторами ПГА в водных экосистемах, в отличие от почвенных, где наибольшее значение имеют микромицеты.