Задача молекулярной характеристики патогенов направлена на детальную оценку бактериального звена эпидемиологической ситуации. Внимание уделено разнообразию возбудителей на генном и геномном уровнях, а также роли мобильных генетических элементов в дифференцировке патогенных потенций штаммов. Прогресс в анализе полногеномных последовательностей патогенов внес большой вклад в технологию характеристики микроорганизмов. Проблема рассматривается на модели патогенных стрептококков, вызывающих политропную патологию с высоким уровнем социально-экономических потерь