Рассмотрены данные отечественной и зарубежной научной литературы, посвященной исследованиям влияния антропогенных загрязнений и природных включений подземных вод на здоровье населения. Обоснованы необходимость прогнозирования медико-экологической обстановки, зависящей от изменения качества и количества питьевых подземных вод, возможность адаптации современных методов прогнозирования уровня и характера заболеваемости, связанной с прямым и косвенным влиянием водного фактора. Показаны роль и место этих разработок в системе водохозяйственных управленческих решений. Обоснована целесообразность формирования нового научного направления — медицинской гидрогеологии.