Одним из основных принципов, положенных в основу концепции создания национального исследовательского университета в области строительства и архитектуры, заявленной Московским государственным строительным университетом (МГСУ) совместно с академическим сообществом архитектурно-строительных вузов России на конкурсный отбор программ развития университетов, в отношении которых устанавливается категория «национальный исследовательский университет» в рамках реализации федерального закона от 10 февраля 2009 г. № 18-ФЗ «О внесении изменений в отдельные законодательные акты РФ по вопросам деятельности федеральных университетов» и постановления правительства РФ от 13 июля 2009 г. № 550 «О конкурсном отборе программ развития университетов, стал принцип научной интеграции. Он подразумевает формирование эффективной инновационной инфраструктуры и содержания научно-исследовательской деятельности в отрасли на основе эффективной реализации научного и творческого потенциала коллектива сотрудников и стратегических партнеров университета – научных учреждений отрасли, координируемых Российской академией архитектуры и строительных наук (РААСН), развития приоритетных исследовательских направлений отраслевой и академической прикладной и фундаментальной науки, ориентированных на создание исследовательского центра мирового уровня, коммерциализацию и трансфер технологий в реальный сектор экономики.